关于90%股权行使控制权时，常见的错误操作可能影响权益，以下为您列举：
1. 忽视公司章程特殊条款：部分股东认为持股90%自然拥有绝对控制权，未仔细查看公司章程中关于表决权的特殊约定（如某些事项需全体股东同意），导致在决策时因不符合章程要求而无效。
2. 未留存完整股权证据：部分股东未妥善保存股权出资证明、工商登记文件等材料，当其他股东对股权比例提出异议时，无法有效证明90%股权的归属，进而影响控制权的行使。
3. 滥用控制权损害小股东利益：部分持股90%的股东过度行使控制权，如通过不合理的股东会决议转移公司资产、损害小股东权益，可能引发小股东的诉讼，导致控制权行使的合法性受到挑战。
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90%股权能否绝对控股公司，还需考虑以下特殊情况或例外情形：
1. 公司章程设置超级表决权条款：若公司章程约定某些重大事项（如公司合并、分立）需代表95%以上表决权的股东通过，即使持股90%，也无法单独决定该事项，此时90%股权不能绝对控股。这种情形下，控制权的行使需满足更高的表决权比例要求，直接限制了90%股权的控制权范围。
2. 存在优先股股东的一票否决权：若公司发行的优先股对特定事项（如公司对外投资超过注册资本50%）有一票否决权，即使普通股股东持股90%，也需优先股股东同意才能通过相关决议。例如：公司优先股股东D对公司对外投资有一票否决权，持股90%的普通股股东E提议投资某项目，D不同意，该决议无法通过，E的控制权因此受限。
3. 股东协议约定一致行动条款：若股东协议约定部分股东形成一致行动人（如持股10%的股东F与其他小股东形成一致行动人，合计持股15%），且约定一致行动人对重大事项统一表决，此时持股90%的股东若无法获得一致行动人的支持，可能无法通过需更高比例表决权的决议（如修改章程），影响绝对控制权的行使。
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针对90%股权能否绝对控股公司的直接回复，可依据《中华人民共和国公司法》相关条款进行法律分析：
根据《中华人民共和国公司法》第四十二条：“股东会会议由股东按照出资比例行使表决权；但是，公司章程另有规定的除外。” 第四十三条：“股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。”
结合问题，90%股权对应的表决权通常超过三分之二，若公司章程无特殊约定，股东可凭此表决权通过所有股东会特别决议及普通决议，符合“绝对控股”的法律定义。但若公司章程或股东协议对表决权比例有更高要求（如需全体股东同意），则需优先适用约定，此时90%股权可能无法绝对控股。综上，无特殊约定时90%股权可绝对控股，有特殊约定时需依约定判断。
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持有90%股权时，仍可能面临以下法律风险，需引起重视：
1. 控制权约定冲突风险：若公司章程与股东协议对控制权的约定不一致（如章程规定过半数通过即可，协议约定需全体同意），可能引发股东之间的纠纷。例如：A持股90%，章程规定修改章程需三分之二表决权通过，但股东协议约定需全体股东同意，A单独通过修改章程的决议后，其他股东以协议约定为由主张决议无效，导致公司决策陷入僵局。
2. 小股东诉讼风险：若持股90%的股东滥用控制权（如通过股东会决议低价转让公司资产），小股东可依据《公司法》第二十条“股东不得滥用股东权利损害公司或其他股东利益”的规定提起诉讼，要求撤销决议并赔偿损失。例如：B持股90%，通过股东会决议将公司房产以低于市场价格转让给关联方，小股东C以B滥用控制权为由起诉，法院判决决议无效，B需承担赔偿责任。

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